בשעת  חירום, אגף ההנדסה אחראי לטיפול בדרכים הציבוריות, כבישים, תשתיות, מבנים ציבוריים. הטיפול בשעת חירום הינו לפעולות מצילות חיים (פינוי עצים המהווים סכנה, פריצת דרכים ועורקים ראשיים, טיפול במבנים המהווים סכנה ועוד).

במקרים של מבנים פרטיים: האחריות לטיפול ובטחון בני הבית הינה של התושבים. אחריות  עיריית צפת לציבור, הינה רק כאשר מדובר בסכנת חיים. במידה וקיימת פגיעה במבנה המהווה סכנת חיים, העירייה תדאג לפנות את יושבי הבית למקום חליפי. התושבים יוכלו לחזור לביתם רק לאחר שיוצגו כל האישורים לאכלוס מחדש.

במקרה של פגיעה חלקית בבית, למשל פרגולה הנוטה ליפול ומהווה סיכון, העירייה, על פי שיקול דעתה רשאית  לבצע הסרה של המפגע או תיחום אזור המפגע, מבלי לפנות את התושבים. מובהר כי עיריית צפת לא תבצע תיקון או בניה מחדש.

בשעת חירום אגף ההנדסה, חובר למטה החירום של העירייה. על פי הצורך ניתן ליצור קשר באמצעות המוקד העירוני.